Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R6

Coa3, Cytochrome c oxidase assembly factor 3 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coa3Q9D2R6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Coa3Q9D2R6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Coa3Q9D2R6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms