Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mrpl28Q9D1B9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms