Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Arv1Q9D0U9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms