Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdhd3Q9CYW4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdhd3Q9CYW4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms