Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mis12Q9CY25 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mis12Q9CY25 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms