Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem175Q9CXY1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem175Q9CXY1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem175Q9CXY1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem175Q9CXY1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem175Q9CXY1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem175Q9CXY1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem175Q9CXY1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem175Q9CXY1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms