Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
3100002H09RikQ9CXW6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
3100002H09RikQ9CXW6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
3100002H09RikQ9CXW6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms