Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nip7Q9CXK8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Nip7Q9CXK8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms