Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RpainQ9CWY9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RpainQ9CWY9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RpainQ9CWY9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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