Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700029F12RikQ9CRB4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms