Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec61bQ9CQS8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sec61bQ9CQS8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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