Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pkp2Q9CQ73 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pkp2Q9CQ73 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp2Q9CQ73 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms