Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc18Q9CQ07 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc18Q9CQ07 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms