Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Prpf8Q99PV0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prpf8Q99PV0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prpf8Q99PV0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms