Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab27bQ99P58 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab27bQ99P58 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms