Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cstf3Q99LI7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cstf3Q99LI7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cstf3Q99LI7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms