Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arrdc1Q99KN1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arrdc1Q99KN1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms