Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EpcamQ99JW5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EpcamQ99JW5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms