Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBGCP6Q96RT7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBGCP6Q96RT7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBGCP6Q96RT7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TUBGCP6Q96RT7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TUBGCP6Q96RT7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TUBGCP6Q96RT7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TUBGCP6Q96RT7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TUBGCP6Q96RT7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TUBGCP6Q96RT7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBGCP6Q96RT7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBGCP6Q96RT7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms