Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sfxn4Q925N1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms