Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xrcc4Q924T3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xrcc4Q924T3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xrcc4Q924T3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms