Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn1Q922Y1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ubxn1Q922Y1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms