Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1bQ920F6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc1bQ920F6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc1bQ920F6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms