Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab29Q91YQ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab29Q91YQ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms