Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Basp1Q91XV3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms