Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vps36Q91XD6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vps36Q91XD6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vps36Q91XD6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms