Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx7Q8VDS3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms