Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC155Q8N6L0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC155Q8N6L0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms