Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hecw1Q8K4P8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hecw1Q8K4P8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms