Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rbm48Q8K2X2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rbm48Q8K2X2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms