Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc12Q8K2L8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc12Q8K2L8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc12Q8K2L8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms