Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syne4Q8CII8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syne4Q8CII8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms