Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ercc8Q8CFD5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc8Q8CFD5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms