Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc38Q8CDN8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc38Q8CDN8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc38Q8CDN8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc38Q8CDN8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc38Q8CDN8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc38Q8CDN8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms