Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
6030452D12RikQ8CD33 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
6030452D12RikQ8CD33 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
6030452D12RikQ8CD33 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
6030452D12RikQ8CD33 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms