Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vwc2Q8C8N3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vwc2Q8C8N3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vwc2Q8C8N3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vwc2Q8C8N3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vwc2Q8C8N3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vwc2Q8C8N3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vwc2Q8C8N3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vwc2Q8C8N3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vwc2Q8C8N3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vwc2Q8C8N3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vwc2Q8C8N3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vwc2Q8C8N3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vwc2Q8C8N3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vwc2Q8C8N3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vwc2Q8C8N3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms