Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe22Q8C6A8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe22Q8C6A8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe22Q8C6A8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe22Q8C6A8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms