Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc169Q8BXX9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc169Q8BXX9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms