Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Als2cr12Q8BVM7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Als2cr12Q8BVM7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Als2cr12Q8BVM7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Als2cr12Q8BVM7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Als2cr12Q8BVM7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Als2cr12Q8BVM7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Als2cr12Q8BVM7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Als2cr12Q8BVM7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms