Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gabra5Q8BHJ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gabra5Q8BHJ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms