Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFQ9

Klhl42, Kelch-like protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl42Q8BFQ9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl42Q8BFQ9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhl42Q8BFQ9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Klhl42Q8BFQ9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl42Q8BFQ9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms