Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc172Q810N9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms