Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem39bQ810L4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem39bQ810L4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem39bQ810L4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms