Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zer1Q80ZJ6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Zer1Q80ZJ6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Zer1Q80ZJ6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Zer1Q80ZJ6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zer1Q80ZJ6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zer1Q80ZJ6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zer1Q80ZJ6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zer1Q80ZJ6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zer1Q80ZJ6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zer1Q80ZJ6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms