Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc27Q80YS5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc27Q80YS5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc27Q80YS5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc27Q80YS5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrc27Q80YS5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc27Q80YS5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc27Q80YS5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc27Q80YS5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrc27Q80YS5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Lrrc27Q80YS5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Lrrc27Q80YS5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Lrrc27Q80YS5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Lrrc27Q80YS5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc27Q80YS5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Lrrc27Q80YS5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Lrrc27Q80YS5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc27Q80YS5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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