Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rexo1Q7TT28 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo1Q7TT28 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo1Q7TT28 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms