Protein–RNA interactions for Protein: Q794H2

Nap1l3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nap1l3Q794H2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nap1l3Q794H2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nap1l3Q794H2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nap1l3Q794H2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms