Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc9c1Q6UJY2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slc9c1Q6UJY2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9c1Q6UJY2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms