Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Bnip1Q6QD59 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms