Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kcnip4Q6PHZ8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms